Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms