Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sppl2bQ3TD49 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms