Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hdgfl1Q2VPR5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hdgfl1Q2VPR5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms