Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp8Q2V6D6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp8Q2V6D6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms