Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Samd11Q1RNF8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms