Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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ptchd1Q14B62 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ptchd1Q14B62 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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ptchd1Q14B62 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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ptchd1Q14B62 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ptchd1Q14B62 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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