Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Spatc1Q148B6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms