Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnnm1Q0GA42 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnnm1Q0GA42 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms