Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700061G19RikQ08EE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms