Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnma1Q08460 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnma1Q08460 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms