Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnn2Q08093 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms