Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CluQ06890 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CluQ06890 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CluQ06890 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CluQ06890 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CluQ06890 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CluQ06890 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CluQ06890 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CluQ06890 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CluQ06890 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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