Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPINDOCQ05AH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SPINDOCQ05AH6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms