Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Caprin2Q05A80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms