Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CkbQ04447 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CkbQ04447 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CkbQ04447 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms