Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Msx2Q03358 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Msx2Q03358 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms