Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Muc1Q02496 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Muc1Q02496 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms