Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctnnb1Q02248 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctnnb1Q02248 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms