Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mc1rQ01727 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms