Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sec23aQ01405 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms