Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja5Q01231 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gja5Q01231 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms