Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Col1a2Q01149 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms