Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grin2cQ01098 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms