Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VegfaQ00731 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VegfaQ00731 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms