Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa1Q00623 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apoa1Q00623 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms