Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbp10Q000W5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms