Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
rp9P97762 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
rp9P97762 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
rp9P97762 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
rp9P97762 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
rp9P97762 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
rp9P97762 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
rp9P97762 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
rp9P97762 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
rp9P97762 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
rp9P97762 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
rp9P97762 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
rp9P97762 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
rp9P97762 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms