Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vgll3P85442 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vgll3P85442 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms