Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx1P83917 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx1P83917 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms