Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabpb2P81069 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabpb2P81069 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms