Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx1P81068 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Irx1P81068 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.1 ms