Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb4bP68372 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tubb4bP68372 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms