Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tuba4aP68368 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms