Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkacbP68181 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms