Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Polr2lP62876 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Polr2lP62876 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms