Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rab3cP62823 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rab3cP62823 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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