Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snrpd2P62317 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snrpd2P62317 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms