Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Rps29P62274 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Rps29P62274 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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