Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf13P61216 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf13P61216 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf13P61216 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms