Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snap25P60879 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snap25P60879 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snap25P60879 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snap25P60879 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Snap25P60879 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms