Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrnp3P59055 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrnp3P59055 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms