Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Samsn1P57725 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Samsn1P57725 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms