Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NcstnP57716 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NcstnP57716 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms