Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TdgP56581 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TdgP56581 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TdgP56581 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TdgP56581 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TdgP56581 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms