Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CckbrP56481 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CckbrP56481 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CckbrP56481 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms