Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab8aP55258 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms