Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sh3bp1P55194 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp1P55194 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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