Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Abcd3P55096 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Abcd3P55096 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms