Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Aqp4P55088 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms