Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PitpnbP53811 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PitpnbP53811 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PitpnbP53811 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PitpnbP53811 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PitpnbP53811 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PitpnbP53811 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PitpnbP53811 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PitpnbP53811 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms